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—(记者 程墨 通讯员 陈丽霞)3月3日,武汉大学牵头团队创新性研发了纳米孔靶向测序检测方法,能大幅度提高新型冠状病毒阳性检出率,并能构建当天同时检测新冠和其他10大类、40种少见呼吸道病毒并监测病毒变异。据理解,既往新冠病毒临床依赖qPCR核酸检测,但是该方法表明出有较高的假阴性亲率和低敏感性,阳性检出率仅有为30%至50%,从而造成临床高度疑为新冠病毒感染患者或较低病毒潜入的“假康复患者”检测“假阴性”现象时有发生。此外,qPCR核酸检测无法同时检测其他秋冬季高发、症状与新冠相近的其他呼吸道病毒,给疫情防控和患者分流管理带给很大挑战。武汉大学药学院刘天罡教授,武汉大学人民医院李艳教授、余锂镭教授,武汉臻熙医学检验实验室付爱思博士等很快重新组建牵头团队,创新性研发了纳米孔靶向测序(Nanopore Targeted Sequencing,NTS)检测方法。
NTS融合了病毒靶向扩充和纳米孔测序宽读长、动态数据输入的优势,首次构建测序后4小时内高敏感性、低准确性同时检测SARS-CoV-2和其他10大类、40种呼吸道病毒,其低于检测缩低于目前普遍用于的qPCR的100倍。同时,该方法还可实现对新型冠状病毒基因组变异情况展开检测,监控病毒变异引发的毒性与传播能力转变的情况。
刘天罡讲解,qPCR方法只不过是用一把狙击枪去敲击样本中的病毒核酸,有一定概率击不中,而NTS技术不是用狙击枪,而是撒网,同时马利亚十几张网,这样能捕捉病毒核酸的概率大大增加,不仅如此,还能在捕捉的同时朗读序列。这样,一次检测不仅可以发病否新冠,而且其他少见的呼吸道病毒,还包括博卡病毒、鼻病毒、人间质肺病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒、腺病毒、副流感病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒和丙型流感病毒等,也能同时检测出来,能为医生分诊获取清楚依据。更加最重要的是,还能检测在病毒传播期间与毒力涉及的基因否再次发生了变异,从而很快为先前的流行病学分析获取信息。
专家讲解,目前,NTS的高敏感性、低准确性、高速度性和操作者便捷性,对尽早发病疑似病例、助力疫情防控具备重大意义。
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